Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAF4O95104 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms