Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UFL1O94874 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UFL1O94874 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UFL1O94874 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UFL1O94874 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UFL1O94874 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UFL1O94874 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UFL1O94874 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UFL1O94874 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UFL1O94874 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UFL1O94874 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UFL1O94874 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UFL1O94874 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UFL1O94874 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UFL1O94874 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UFL1O94874 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UFL1O94874 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UFL1O94874 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UFL1O94874 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UFL1O94874 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UFL1O94874 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UFL1O94874 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UFL1O94874 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UFL1O94874 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UFL1O94874 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms