Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITX3O75364 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PITX3O75364 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PITX3O75364 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITX3O75364 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms