Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDM4AO75164 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms