Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NPHP4O75161 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NPHP4O75161 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms