Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUBNO60494 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUBNO60494 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUBNO60494 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms