Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPLO60437 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PPLO60437 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PPLO60437 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPLO60437 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPLO60437 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPLO60437 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPLO60437 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPLO60437 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPLO60437 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPLO60437 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPLO60437 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPLO60437 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPLO60437 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPLO60437 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPLO60437 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPLO60437 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPLO60437 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPLO60437 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPLO60437 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPLO60437 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPLO60437 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPLO60437 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPLO60437 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PPLO60437 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPLO60437 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPLO60437 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPLO60437 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPLO60437 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPLO60437 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPLO60437 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPLO60437 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPLO60437 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPLO60437 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPLO60437 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPLO60437 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPLO60437 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPLO60437 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPLO60437 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPLO60437 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPLO60437 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPLO60437 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPLO60437 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPLO60437 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPLO60437 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPLO60437 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPLO60437 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PPLO60437 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPLO60437 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PPLO60437 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPLO60437 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPLO60437 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPLO60437 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PPLO60437 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPLO60437 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms