Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM3APO60318 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms