Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDIL3O43854 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms