Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRNO43815 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRNO43815 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRNO43815 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRNO43815 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STRNO43815 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STRNO43815 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRNO43815 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRNO43815 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STRNO43815 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms