Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXO3O43524 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXO3O43524 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXO3O43524 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXO3O43524 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXO3O43524 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXO3O43524 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXO3O43524 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXO3O43524 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXO3O43524 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FOXO3O43524 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.51■■■□□ 2
FOXO3O43524 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXO3O43524 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms