Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRID2O43424 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRID2O43424 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRID2O43424 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRID2O43424 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRID2O43424 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRID2O43424 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms