Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NUPL2O15504 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NUPL2O15504 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms