Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBTB39O15060 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms