Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNAP23O00161 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNAP23O00161 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms