Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C6orf229H3BNL8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C6orf229H3BNL8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms