Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BML4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BML4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BML4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BML4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BML4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms