Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E9PMD0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E9PMD0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PMD0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PMD0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PMD0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PMD0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PMD0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PMD0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
E9PMD0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E9PMD0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E9PMD0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
E9PMD0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E9PMD0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms