Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms