Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPA5E9PKD4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms