Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SMIM1B2RUZ4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms