Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KNCNA6PVL3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KNCNA6PVL3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms