Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SDR42E2A6NKP2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms