Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85CA6NKD9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms