Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SERINC4A6NH21 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERINC4A6NH21 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms