Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L4A6NCW7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L4A6NCW7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms