Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A4D1N5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A4D1N5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A4D1N5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
A4D1N5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms