Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWA8A3KMH1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms