Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SLFN12-202ENST00000394562 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 IL6-202ENST00000401630 765 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 LRRC37A11P-202ENST00000579258 3717 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 SYNPO2-204ENST00000448416 4298 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 LMO7-201ENST00000321797 5647 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AC008938.1-201ENST00000566929 6510 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 MAPK10-285ENST00000641207 2746 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 KRTAP3-3-201ENST00000391586 704 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AC124319.3-201ENST00000616832 526 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 LINC01695-203ENST00000453420 4486 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 ANAPC5-208ENST00000535482 2077 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 ATL1-202ENST00000441560 2853 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 TRAF3IP2-207ENST00000368761 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 HHLA1-202ENST00000434736 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 U3.18-201ENST00000390880 216 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AKAP2-201ENST00000259318 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 PINK1-AS-201ENST00000451424 4443 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 CACNA1C-201ENST00000327702 6616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
POLR2AP24928 LINC02312-201ENST00000555187 3046 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms