Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 YTHDF2P1-201ENST00000604759 1271 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LINC00635-221ENST00000609366 784 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 NUDT13-208ENST00000617744 928 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC245028.3-201ENST00000618197 285 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.212-201ENST00000636778 248 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 GZMB-203ENST00000382542 666 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL359475.1-201ENST00000414505 292 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RBMY2YP-201ENST00000423333 912 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LINC01865-202ENST00000436808 853 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC084809.2-201ENST00000444464 512 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 DBIL5P-202ENST00000453414 250 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 BX890604.1-206ENST00000471090 922 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RN7SL239P-201ENST00000490061 300 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC009171.1-201ENST00000572673 266 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC026254.4-201ENST00000581118 454 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC073911.1-201ENST00000592296 504 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 EIF5P2-201ENST00000618904 1035 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.42-201ENST00000621081 348 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AP000851.2-201ENST00000629499 721 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 HCCAT5-202ENST00000642127 1029 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL031676.1-201ENST00000412519 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 GPD2-203ENST00000409674 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 FCGR2A-202ENST00000367972 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 OR4D6-201ENST00000300127 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 CPSF4L-201ENST00000344935 647 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 HMGB1P39-201ENST00000366304 880 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 OR2AK2-201ENST00000366480 1154 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RPL5P35-201ENST00000398869 816 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC008937.2-201ENST00000415589 619 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 LINC01424-201ENST00000417820 1031 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC004160.2-201ENST00000425837 563 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ATP5G1P5-201ENST00000429024 411 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 GAPDHP32-201ENST00000433816 998 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AL590648.1-201ENST00000456479 460 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PDK4Q16654 GNPTAB-203ENST00000549165 373 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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