Protein–RNA interactions for Protein: S4R3F8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3F8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
S4R3F8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
S4R3F8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
S4R3F8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
S4R3F8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
S4R3F8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
S4R3F8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
S4R3F8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
S4R3F8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
S4R3F8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
S4R3F8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
S4R3F8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
S4R3F8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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