Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A4Q9Y6R1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC4A4Q9Y6R1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms