Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX13Q9Y5W8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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SNX13Q9Y5W8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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SNX13Q9Y5W8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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SNX13Q9Y5W8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX13Q9Y5W8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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