Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL4A3BPQ9Y5P4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL4A3BPQ9Y5P4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms