Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CD2APQ9Y5K6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms