Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms