Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KNSTRNQ9Y448 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KNSTRNQ9Y448 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms