Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HIF3AQ9Y2N7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HIF3AQ9Y2N7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms