Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP20Q9Y2K6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP20Q9Y2K6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms