Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms