Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNQ9UQP3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNQ9UQP3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNQ9UQP3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNQ9UQP3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNQ9UQP3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNQ9UQP3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms