Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KIAA1024Q9UPX6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms