Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SETD1BQ9UPS6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1BQ9UPS6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms