Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTF2Q9UNY4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms