Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
L1RE1Q9UN81 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
L1RE1Q9UN81 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms