Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP18Q9UMW8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP18Q9UMW8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms