Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DENND2AQ9ULE3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DENND2AQ9ULE3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms