Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms