Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA1Q9UJY5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms