Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHY1

NRBP1, Nuclear receptor-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBP1Q9UHY1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRBP1Q9UHY1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms